חובות בהיקף מיליוני שקלים שהיו רשומים בספרי העירייה במשך שנים רבות מנעו ממשרד הפנים לסייע לעירית צפת בטענה כי קודם כול יש לגבות את החובות ולאחר מכן לבקש סיוע.
מבדיקה שערכה העירייה הסתבר כי חלק נכבד מהחובות כלל אינו ניתן לגבייה שכן מדובר באנשים או משפחות שנפטרו או עזבו את הארץ או מכרו את הנכס ורישום החובות בפנקסי העריה רק מקשה על קבלת תקציבים.
בבדיקה עם משרד הפנים והממונה על המחוז יוסי ברון הסתבר כי קיים נוהל לפיו על העיירה להקים ועדה מיוחדת שתדון בכול חוב וחוב בנפרד, במידה ויסתבר כי אכן מדובר בחוב אבוד תוגש בקשה למשרד הפנים לממונה על המחוז וזה ימחק את החוב מפנקסי העיריה. במשרד הפנים הביעו תדהמה מכך שעד היום לא נעשה שימוש בנוהל הזה.
בעירייה מדגישים כי ההסדר תקף רק על חובות של מים וביוב שמוצו עליהן תהליכי גבייה כולל עיקולים ועבר עליהן שבע שנים וכן אין נכס לבעל החוב.
חובות ארנונה נדונים בוועדת נפרדת הבוחנת את מצבם הכלכלי של החייבים ומוסמכת לאשר רק במקרים של בעיות רפואיות וכלכליות המגובות במסמכים, רק לאחר שלוש שנים ומיצוי של הליכי גבייה.